Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP44Q96MT7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP44Q96MT7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms