Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRRC1Q96M27 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms