Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNBD2Q96M20 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms