Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms