Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPNS2Q96L46 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms