Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms