Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms