Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms