Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC11Q96J66 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC11Q96J66 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC11Q96J66 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC11Q96J66 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC11Q96J66 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC11Q96J66 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms