Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms