Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJA3Q96EY1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJA3Q96EY1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms