Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX58Q96C10 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX58Q96C10 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms