Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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