Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC4Q92889 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms