Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RGP1Q92546 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RGP1Q92546 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms