Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP3Q8WYN3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CSRNP3Q8WYN3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms