Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIPC3Q8TF64 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIPC3Q8TF64 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIPC3Q8TF64 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIPC3Q8TF64 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIPC3Q8TF64 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIPC3Q8TF64 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIPC3Q8TF64 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIPC3Q8TF64 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms