Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
RB1CC1Q8TDY2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms