Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACER1Q8TDN7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms