Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX54Q8TDD1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms