Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00301Q8NCQ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms