Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms