Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTROBQ8N137 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTROBQ8N137 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms