Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms