Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP2Q86UW6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP2Q86UW6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms