Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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