Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHA9Q7RTU4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms