Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms