Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HECW1Q76N89 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms