Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP34Q70CQ2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP34Q70CQ2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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