Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms