Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms