Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms