Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms