Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM88Q6PEY1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms