Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms