Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCSD1Q6JBY9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms