Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CARMIL2Q6F5E8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CARMIL2Q6F5E8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms