Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms