Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms