Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms