Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RSPH4AQ5TD94 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms