Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms