Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CC2D1BQ5T0F9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms