Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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