Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms