Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms