Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms