Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6CQ53S08 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms