Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms